Российская подводная лодка специального назначения с ракетным вооружением бесследно пропадает во время выполнения секретной операции в Гренландском море. Для её поисков направляется команда под руководством Виктора Воронина, чей старший брат был капитаном исчезнувшего судна. Моряки получают задание обнаружить субмарину любыми способами и предотвратить попадание новейшего секретного оружия в руки противника.
Одновременно с этим геологические изыскания на полярной станции в северных морях приводят к пробуждению Кракена — огромного монстра, умеющего сливаться с подводным мраком и обладающего развитым интеллектом. Именно с этим существом и предстоит встретиться экипажу, занятому поисками пропавшей подлодки.